*** PHYLOGENETIC META DATA FOR SBCP 2021 challenge ***

Here is the phylogenetic tree [Thuillier et al. Nature, 2011], in simple presentation without distances, and with the distances between species.
It was previously given for the ICML2013 Challenge too.


a) This tree with phylogenetic distances distances : 
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Even if two species are missing in this phylogenetic tree (Branta_canadensis (Bernache du Canada) and Phasianus_colchicus"(Faisan de colchide)) the other 33 species are depicted and this information may help in bioacoustic classification. 

This tree is in usual parenthesis format, you may use R or you favorite parser to read it, please ask glotin@univ-tln.fr if you need help : 

"(((((Dendrocopos_major:44.057453,Picus_viridis:44.057453):66.019537,Strix_aluco:110.07699):5.080376,((Oriolus_oriolus:65.002373,(Corvus_corone:28.891841,Garrulus_glandarius:28.891841):36.110532):11.581989,(((Parus_palustris:15.522246,(Parus_caeruleus:13.06567,(Parus_cristatus:8.070138,Parus_major:8.070138):4.995532):2.456575):51.992641,(((Aegithalos_caudatus:53.819063,Phylloscopus_collybita:53.819063):3.776522,Sylvia_atricapilla:57.595585):4.770538,Alauda_arvensis:62.366124):5.148763):2.480186,(((((Fringilla_coelebs:42.033805,Carduelis_chloris:42.033806):5.438925,Emberiza_citrinella:47.47273):3.806638,(Anthus_trivialis:36.737723,Motacilla_alba:36.737723):14.541646):7.625172,Prunella_modularis:58.90454):9.776254,((((Turdus_viscivorus:16.264356,(Turdus_merula:15.05788,Turdus_philomelos:15.05788):1.206476):34.860848,Sturnus_vulgaris:51.125203):1.913714,((Phoenicurus_phoenicurus:31.387733,Luscinia_megarhynchos:31.387732):6.161319,Erithacus_rubecula:37.549052):15.489866):11.75211 ,(Sitta_e uropaea:55.513645,(Troglodytes_troglodytes:50.319549,Certhia_brachydactyla:50.319549):5.194097):9.277382):3.889767):1.314278):6.58929):38.573004):2.361694,Cuculus_canorus:117.519059):0.948891,(Columba_palumbus:44.549956,Streptopelia_decaocto:44.549957):73.917994);"

[ extracted from 
Thuiller,W., Lavergne, S., Roquet, C., Boulangeat,I.,Lafourcade,B.,Araujo,M.B.,
2011. Consequences of climate change on the tree of life in Europe.
Nature 470,531–534 ]
 
b) The tree of the 35 bird species without distances :
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It is extracted from http://www.oiseaux.net
http://fr.wikipedia.org/wiki/Aves_%28classification_phylog%C3%A9n%C3%A9tique%29
and is equal to this structure : 

aegithalos caudatus
Ordre : Passériformes
Famille : Aegithalidés

alauda arvensis
Ordre : Passériformes
Famille : Alaudidés

anthus trivialis
Ordre : Passériformes
Famille : Motacillidés

branta canadensis
Ordre : Ansériformes
Famille : Anatidés

carduelis chloris
Ordre : Passériformes
Famille : Fringillidés
Genre : Chloris
Espèce : chloris

certhia brachydactyla  
Ordre : Passériformes
Famille : Certhiidés

columba palumbus
Ordre : Columbiformes
Famille : Columbidés

corvus corone
Ordre : Passériformes
Famille : Corvidés

cuculus canorus
Ordre : Cuculiformes
Famille : Cuculidés

dendrocopos major
Ordre : Piciformes
Famille : Picidés

emberiza citrinella
Ordre : Passériformes
Famille : Emberizidés

erithacus rubecula
Ordre : Passériformes
Famille : Muscicapidés

fringilla coelebs
Ordre : Passériformes
Famille : Fringillidés

garrulus glandarius
Ordre : Passériformes
Famille : Corvidés

luscinia megarhynchos 
Ordre : Passériformes
Famille : Muscicapidés

motacilla alba
Ordre : Passériformes
Famille : Motacillidés

oriolus oriolus
Ordre : Passériformes
Famille : Oriolidés

pavo cristatus
Ordre : Galliformes
Famille : Phasianidés

parus caeruleus
Ordre : Passériformes
Famille : Paridés
Genre : Cyanistes

parus major
Ordre : Passériformes
Famille : Paridés

parus (Poecile) palustris
Ordre : Passériformes
Famille : Paridés
Genre : Poecile

phasianus colchicus
Ordre : Galliformes
Famille : Phasianidés

phoenicurus phoenicurus
Ordre : Passériformes
Famille : Muscicapidés

phylloscopus collybita
Ordre : Passériformes
Famille : Phylloscopidés

picus viridis
Ordre : Piciformes
Famille : Picidés

prunella modularis
Ordre : Passériformes
Famille : Prunellidés 

sitta europaea
Ordre : Passériformes
Famille : Sittidés

streptopelia decaocto
Ordre : Columbiformes
Famille : Columbidés

strix aluco
Ordre : Strigiformes
Famille : Strigidés

sturnus vulgaris
Ordre : Passériformes
Famille : Sturnidés

sylvia atricapilla
Ordre : Passériformes
Famille : Sylviidés

troglodytes troglodytes
Ordre : Passériformes
Famille : Troglodytidés

turdus merula
Ordre : Passériformes
Famille : Turdidés 

turdus philomelos  
Ordre : Passériformes
Famille : Turdidés

turdus viscivorus
Ordre : Passériformes
Famille : Turdidés